近来,雅培公司和密苏里大学的研讨人员研讨人员判定出一种新式的HIV毒株,该毒株是HIV-1群M型的一部分。该研讨成果于2019年11月6号宣布在期刊Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes上。
人类免疫缺点病毒(HIV)大盛行的来历可追溯到刚果民主共和国(DRC),据估计该病在1920年代呈现。与该区域HIV的前期传达相一致,DRC菌株显现出广泛的遗传多样性,包含一切公认的亚型,许多循环重组方式(CRF)以及很多共同的重组方式(URF)和无法分类的序列。
当时的HIV命名原则规则,至少需求三个非传达相关病例的完好基因组序列,才能为HIV建立新的亚型或CRF分类。两个无法分类的完好基因组序列83CD003(AF286236)和90CD121E12(AF457101)形成了一个与其他亚型和CRF不同的分支,该分支与相邻的亚型H和J等距,因而提出了一个主张,即这些序列是新亚型的成员,该提案进一步得到每个基因组与一切其他M组亚型的13.2-14.5%核苷酸差异的支撑。这些菌株别离于1983年和1990年在刚果民主共和国搜集,在其他当地未发现。因为L型不是正式分类,因而这些别离物一般不包含在用于对HIV序列进行分类的参阅序列比对中。
图A.
HIV-1组M最大似然体系树(7578 bp)显现了CG-0018a-01组的序列
研讨人员表明这种称为HIV-1 M类亚型L的新毒株极为稀有,该研讨共筛查了全球超越60%的血液样本,而且要确保挑选“每次都有必要正确”,可见其作业强度之大,作业难度也是不可思议的高。
样本CG-0018a-01于2001年搜集在距刚果民主共和国开赛西省卡南加12公里的Good Shepard医院,依据扩增的亚基因组PCR片段序列,因为低病毒载量(
但是,现在科学家们尚不清楚该种HIV病毒的新变种会以什么样的方式进入传达媒介,以及现在的一些相应医治艾滋病的手法是否对其有用,都仍是个未解之谜。这一发现提示咱们,要完毕艾滋病毒大盛行,有必要继续继续重视HIV病毒株的改变,并使用技能和资源的最新进展来监测其演化。
修改:苏复
来历:BioWorld
文献链接:
https://journals.lww.com/jaids/Abstract/publishahead/Complete_genome_sequence_of_CG_0018a_01.96307.aspx